Learning about the construction rules for proteins

In den letzten Jahren ist die Menge an Proteinsequenzdaten explosionsartig gewachsen. Viele interessante Informationen sind in den Datenbanken verborgen und könnten möglicherweise zahlreiche Fragen von wissenschaftlichem und medizinischem Interesse beantworten. Dieses Projekt befasst sich mit der Frage, welchen Einschränkungen Proteinsequenzen unterliegen.

Anhand von Alignments funktional äquivalenter Proteine kann nach Regelmäßigkeiten wie korrelierten Positionen oder Residuum-Mustern gesucht werden. Es wird angenommen, dass diese Regelmäßigkeiten notwendig sind, um eine bestimmte Faltung und verschiedene zelluläre Funktionen sicherzustellen. Das entwickelte Visual-Analytics-Tool VisAlign unterstützt die Analyse, indem es eine automatische Berechnung von Korrelationen mit einer interaktiven Visualisierung kombiniert.